江戸時代、伏見は伏見奉行が支配した。奉行とは幕府直轄領（幕領）のうち重要な場所に置かれ、その土地の政務を取り扱った。このような遠国奉行は、幕末時点で16名存在した。その中で伏見奉行だけが大名が充てられており、重要な役職であったことがうかがえる。
１．伏見城代時代
慶長5年（1600年）の関ケ原後、伏見は松平下野守（家康四男松平忠吉・清洲城主60万6千石）の支配に属した。慶長7年（1602年）12月、伏見城在番制が定められ、京都所司代の指揮下におかれることとなった。慶長12年（1607年）閏4月、掛川城主松平隠岐守定勝（家康の異父同母の弟）が伏見城代に任命された。家康曰く、『伏見は天下枢要の地なるを以て、ここに在城せんと欲するも、思ふところありて駿府を座城とせしかば、伏見警護のためには、譜第勇敢の士を以て当たらしめ、武具兵糧を蓄えたり、若し不慮のことあらんには、汝固く守りて怠る勿れ』。慶長19年の大阪冬の陣の際は徳川軍の大本営となる。定勝は役後元和３年（1617年）に天封し、12月に内藤紀伊守信正（高槻城主）が城代に。同５年伏見城廃城令。内藤紀伊守信正は大阪城の城代に。この間、舎人源太左衛門を含めて５名が、4年～14年奉行職につく。この頃奉行は2名いた。
２．廃城後の伏見奉行
元和5年（1619年）～慶応5年（1869年）の間、39名が伏見奉行職につく。この間、伏見奉行は1人→3人→元禄9年～京都町奉行の分任→元に戻る→再び京都町奉行の分任→再びもとに戻る、と少しずつ形が変わっている。
この歴代の奉行の中でも特に有名なのは、以下の4名だろうか。
| 名前 | 在職期間 | 備考 |
| 小堀遠江守政一 江州御室10630石 |
元和9年（1623年）～正保４年（1647年） 25年間 |
いわゆる「小堀遠州」のこと。遠州流茶式の祖。和歌、書画、活花、器物鑑定などに通じていた文化人。 |
| 建部内匠頭政字 播州林田1万石 |
元禄11年（1698年）～正徳4年（1719年） 17年間 |
中書島の開地し、宝来橋、今富橋をかけた。 |
| 小堀和泉守政方 江州御室10630石 |
安永7年（1778年）～天明5年（1785年） 8年間 |
暴政を敷き、改易。いわゆる伏見騒動。伏見義民事件。 |
| 内藤豊後守正縄 信州岩村15000石 |
天保9年（1838年）～安政6年（1859年） 22年間 |
平野権平屋敷跡の池沼を開拓して住家建設。信州より桑を移入して栽培奨励。疫病発生の際は資材を投じて施薬療養。平戸町の荒地を開拓して遊園地を設ける。 |
【本稿執筆にあたって参考した文献など】
- 伏見町誌（昭和3年、伏見町役場） （1972年臨川書店発行の「京都府紀伊郡誌、京都府伏見町誌」に収録、p.291～）
- 伏見叢書（昭和13年、西野伊之助）
